上海市金山区第二实验小学创建于1985年，2003年6月由石化十二村136号搬迁至卫清西路626弄28号。2006年6月，在金山区教育局的宏观规划下，原东礁小学顺利并入，由此揭开了学校发展史上的新篇章。学校分南北两个校区，北校区校园占地面积19983平方米，建筑面积10537平方米，有一幢办公楼、两幢教学楼、各类教学专用室共18间，南校区校园占地面积9313平方米，建筑面积4416平方米，有一幢办公楼、一幢教学楼、各类教学专用室6间·作为全国现代教育技术实验学校.

上海市金山区第二实验小学充分运用多媒体技术辅助教学，进一步推动现代教育技术的实践与运用；作为全国科学教育实验基地，学校以科技教育为突破口，全面实施素质教育，启蒙学生科技意识，培养学生科学精神和创新能力；作为全国中小学棋类教学课题研究实验基地，学校积极开展融竞技、娱乐、科学为一体的棋类教学活动，有目的的在智力、心理品质及习惯等方面对学生进行培养和训练。学校自1987年起开始了低年级外语教学改革试验，2001年又以二期课改为契机，把英语特色延伸拓展到双语领域，把双语教学作为学校新一轮发展的重点工作。